退款时被扣除了1000多手续费，这样做合理吗？

不合理。驾照考试退款需依据合同，无法定退款规范。《合同法》规定，合同双方应公平协商，无明确条款不得随意扣费。若不及时处理，可能面临权益受损，经济损失无法追回。
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处理方式有协商、投诉、诉讼。应先与驾校协商，协商无果可向交管部门投诉或寻求消费者协会帮助，仍无法解决可提起诉讼。
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不合理。处理方式如下：1.与驾校协商，依据合同条款要求合理退款；2.若协商无果，向当地交管部门或消费者协会投诉，寻求调解；3.若仍无法解决，可准备相关证据，向法院提起诉讼，维护自身权益。